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奥地利公开发布SARS-CoV-2病毒的第一个基因组序列

奥地利首批21个SARS-CoV-2基因组现已完成,并在奥地利科学院分子医学研究中心CeMM最近发起的“ SARS-CoV-2突变动力学”项目的范围内发布与维也纳医科大学紧密合作。该项目旨在对从奥地利患者来源的样本中获得的1000个病毒基因组进行测序,以了解有关COVID-19大流行和致病菌的分子理解的更多信息。该项目的结果将把奥地利病毒基因组数据整合到SARS-CoV-2突变的全球图谱中,这将有助于破译COVID-19大流行背后的突变动力学。

冠状病毒SARS-CoV-2引起的COVID-19爆发已于2020年3月12日被世界卫生组织(WHO)宣布为大流行病。据认为,该病已从野生动物传播给人类,已在中国湖北省传播在2019年11月。已有180多个国家受到影响,COVID-19疾病已经造成成千上万人死亡。

为了了解该病毒在人类中的进化,国际研究界已开始公开提供循环SARS-CoV-2病毒的基因组序列。迄今为止,尚未报告来自奥地利的分离株的病毒基因组,这在全球传播途径和该病毒的进化的比较分析中存在相当大的差距。为了克服这个问题,CeMM首席研究员Andreas Bergthaler和Christoph Bock发起了一项合作项目,目的是使用先进的下一代测序技术和复杂的计算分析方法来阐明奥地利患者的SARS-CoV-2基因组。

我们与维也纳医科大学病毒学中心一起,开发了一种快速反应策略,以一种时间有效的方式从患者体内产生SARS-CoV-2全基因组序列。这解决了有关国家公共卫生问题和医学研究的有关问题,例如跟踪由SARS-CoV-2引起的急性呼吸道疾病不同阶段的感染链或时间分辨病毒分析。”

项目负责人兼CeMM首席研究员Andreas Bergthaler

来自奥地利的29,900个核苷酸长的SARS-CoV-2基因组的初步序列分析显示,平均有6个突变与2019年12月在中国湖北省省会武汉市分离的参考基因组不同。观察到的突变数与最近报道的其他SARS-CoV-2基因组一致。观察到的大多数突变都会导致病毒蛋白的变化,为正向选择压力和人类群体进化提供了证据。评估这些突变对病毒生命周期的实际影响及其与宿主和免疫系统的相互作用将在未来的研究范围之内。正在进行的深入基因组分析集中于突变热点,

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