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IRB巴塞罗那和亚马逊联手开发计算工具以对抗COVID-19

当前,有超过10,000篇与冠状病毒感染有关的科学文章。实际上,最近几周,抗击COVID-19的研究已经加速,关于潜在疫苗,疗法和治疗的新的学术论文已发表了4,000余篇。手动处理此信息量将难以管理,从而无法足够快地推进这一迫切需要的研究。由ICREA研究人员Patrick Aloy领导的IRB巴塞罗那结构生物信息学和网络生物学实验室与亚马逊合作开发了一种可以加快这一过程的计算工具。使用人工智能,该工具将“阅读”所有这些文章,并提取与所研究的分子和治疗方法有关的所有相关信息。

通过对最相关科学文献的有限审查,巴塞罗那IRB的研究人员迄今已鉴定出150种具有不同水平的实验证据的化合物,它们可能具有抗COVID-19的活性。

我们现在需要的是使用COVID-19治疗的研究小组介绍其结果。新分子每天将自动被整合一次,因此整个科学界将拥有更新的数据,这将有助于避免重复,并会产生新的假设,从而有助于找到确定的治疗方法。”

ICREA研究员Patrick Aloy

快速合作进行药物发现

化学检查器是一种计算工具,可提供有关具有药理潜力的一百万个分子的信息。IRB巴塞罗那小组的研究人员,《科学》杂志的第一作者,作者Iique Barcelona的Miquel Duran说:“ Chemical Checker旨在处理和编码有关不同化合物对活生物体的影响的复杂数据,以便将其纳入新的人工智能技术中。”研究。

巴塞罗那IRB致力于研究COVID-19

在短短一周的时间里,Aloy的实验室与亚马逊建立了合作关系,从而使该生物信息学工具得以微调。亚马逊搜索科学和AI小组的Hugo Zaragoza说:“我们很高兴能够将人工智能功能用于针对COVID-19的药物发现服务。”亚马逊在文本挖掘,机器学习和自然语言理解方面的经验使科学文章的自动分析得以快速整合到Chemical Checker中。“与亚马逊的合作对于如此迅速地启动和运行该工具至关重要。如果没有其AWS云计算和文本处理功能,这将是不可能的,” Aloy说。

结构生物信息学和网络生物学实验室还参加了欧洲项目RiPCoN,该项目致力于鉴定病毒用于扩展的人类蛋白质。该项目旨在寻找可以调节病毒活性并阻止其复制的药物(已经在市场上或在临床试验中)。

巴塞罗那IRB还在从事与COVID-19相关的其他项目。一个致力于开发一种快速,简单的诊断测试来检测病毒,而另一个致力于开发针对COVID-19的喷雾疗法。另一个项目的重点是通过找到治疗急性呼吸窘迫综合征的方法来降低COVID-19的死亡率,该疾病是该病毒的主要死亡原因。

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